En del proteiner innehåller bara aminosyror
Chymotrypsin. Proteiner som bara innehåller aminosyror kallas "enkla" proteiner
Exempel:
Många proteiner innehåller mer än bara aminosyror
Ribonukleas A. En eller annan icke-aminosyra är bunden (konjugerad) till proteinet
- Kan vara både kovalent och icke-kovalent bunden till proteinet
Den icke-aminosyra som är konjugerad till proteinet kallas den prostetiska gruppen.
- Proteiner kan ha mer än en prostetisk grupp.
- Den prostetiska gruppen är ofta mycket viktig för proteinets biologiska funtkion.
Proteiner som innehåller prostetiska grupper kallas för konjugerade proteiner.

Konjugerade proteiner kan vara:
Lipoproteiner
Innehåller fetter av något slag
Exempel
β1-lipoprotein i blod
Glykoproteiner
Innehåller sockergrupper av något slag
Exempel
Immunoglobuliner
Metalloproteiner
Innehåller en metalljon av något slag
Exempel
Alkoholdehydrogenas (innehåller en zinkjon) (se nedan).
Alkoholdehydrogenas från häst. Alkoholdehydrogenas oxiderar etanol till etanal. På bilden ses etanolmolekylen (ljusblå) interagera med en zinkjon (gul) och den prostetiska gruppen PAD (röd) i proteinets aktiva centrum. Alkoholdehydrogenas är en homodimer, d.v.s. det består av två identiska enheter, somi denna bilden färgats gröna resp. blå. PDB-id: 1adc.