- Vi har redan sett hur man kan bära sig åt för att klona gener.
- Men vad skall man ha den klonade genen till?
- Producera protein eller studera genproduktens funktion
- Studera just den här genens funktion
- Producera protein eller studera genproduktens funktion
- Eukaryot – människa eller mus – gen
- Om vi vill ha stora mängder protein, hur gör vi då?
- Få E. coli att göra det åt oss!
- Hur...?
Man måste ha ett sätt att...
- föra in genen i E. coli.
- En vektor
- särskilja de E. coli som tagit upp genen, från de som inte gjort det
- En selektionsmarkör
- få E. coli att börja uttrycka proteinet
- En induktionsmekanism
- föra in genen i E. coli.
- Vektor (kloningsvektor, expressionsvektor, uttrycksvektor)
Vektorn skall ge oss allt det ovanstående (se nedan)!
Typiskt: En plasmid (men kan vara annat också, som vi skall få se).
- Promotor
- Operator
- Bindningsställe för ribosom
- Polylinker (kloningskassett)
- Innehåller en räcka unika igenkänningssekvenser (d.v.s. de finns ingen annanstans i vektorn) för olika restriktionsenzymer
- Termineringssekvens för transkription
- Selektionsmarkör (vanligen antibiotikaresistens)
- ori
- Repressor som binder operatorn och reglerar promotorn
- Polylinker
- Vi har klippt ut, och renat upp vårt DNA från eukaryota celler. Vad gör vi nu?
- Det restriktionsenzym vi använde, har ju en viss igenkänningssekvens
- Nu väljer vi att klippa upp vår vektor med samma enzym, med igenkänningssekvens i polylinkern, så att vi lätt kan klistra in vår gen där.
- Rita upp detta!
- Promotorn & operatorn
- Finns där, därför att de promotorer och som finns i den eukaryota cellen inte fungerar i E. coli. Den eukaryota promotorn och operatorn har man inte med, när man bara är intresserad av genprodukten.
- Bindningsställe för ribosomen
- OBS: Ribosomen binder inte till DNA!
- När DNA:t transkriberas till mRNA, bildas ett bindningsställe för ribosomen.
- Behövs för att translationen skall vara så effektiv som möjligt
- Termineringssekvens för transkription
- Tja, vi behöver ju inte transkribera hela plasmiden, om och om igen...
- Selektionsmarkör
- När man för över vektorn till E. coli, tas den upp av kanske en cell av tio- eller hundratusen.
- Hur veta vem som gjort det?
- Genom att odla cellerna på antibiotikainnehållande medium!
- Endast de celler, som tagit upp plasmiden överlever! :-)
- ori (origin of replication)
- Plasmiden (vektorn) vill man gärna skall finnas i så stort antal som möjligt i cellen.
- Endast möjligt om den kan replikeras av cellen
- För replikation är ett ori nödvändigt
- Repressor som binder operatorn och reglerar promotorn
- Denna vill man skall vara inducerbar
- Proteinet man vill undersöka, kanske är skadligt för bakterien.
- Därför vill man kontrollera när och hur det uttrycks!
- Exempelvis en lac-repressor, som aktiveras när cellerna odlas på laktosinnehållande medium.
- Då produceras också det önskade proteinet i stor mängd.