Peptidbindningen uppstår när två aminosyror kopplas samman
Kvävet i peptidbindningen har ett fritt elektronpar.
En av elektronerna kan doneras till bindningen mellan C och N (elektronerna delokaliseras).
- Denna bindning får dubbelbindningskaraktär
- Kvävet blir plusladdat, och syret blir minusladdat.
Syret och vätet i peptidbindningen hamnar oftast låsta i trans-konfiguration.
Låsningen gör att alla de sex atomer som sitter i och intill peptidbindningen hamnar i ett och samma plan (gråmarkerat i bilden intill).
Detta ger en stabilitet åt peptidstrukturen
- Denna stabilitet är en förutsättning för att mer komplicerade proteinstrukturer ska kunna uppstå.