Promotorer
RNA-polymeras binder till specifika regioner i DNA:t. Där de börjar sker transkriptionen.
- Dessa regioner kallas promotorer.
Hos E. coli har man identifierat två regioner som innehåller promotorer.
- Ligger ungefär 10 och 35 baspar "innan" (uppströms om) startpunkten för RNA-transkription.
- Det baspar i DNA:t, där transkriptionen börjar, har man kommit överens om att ge numret +1
- Promotorerna ligger sålunda i -10 och -35-regionerna.
DNA-sekvenserna i -35- och -10-regionen är viktiga för hur pass väl RNA-polymeraset binder till DNA:t
- En förändring av endast ett baspar, kan göra att polymeraset binder in 10-falt eller 100-falt sämre.
- På detta viset får cellen en grov reglering av RNA-polymerasets aktivitet.
Initiering av transkriptionen
Initiering av transkriptionen sker i två steg: Bildande av ett s.k. stängt komplex, och bildandet av ett öppet.
Stängt komplex
RNA-polymeraset binder till DNA, och förflyttar sig längs DNA-duplexen tills det stöter på –35-regionen.
- Här binder polymeraset över både -35- och -10-regionen.
Eftersom DNA-molekylen fortfarande är stängd, kallas detta ett stängt komplex.
Öppet komplex
Efter att det stängda komplexet bildats, förflyttar sig RNA-polymeraset till –10-regionen.
Samtidigt snurras DNA-duplexen upp, och öppnas upp så att den första kvävebasen kan börja transkriberas.
